Analisis Ekspresi Gen Osteoporosis Pascamenopause (Studi Kasus : Data Agilent Profil Ekspresi Gen Osteoporosis Pascamenopause GSE230665)

Abstract

Osteoporosis pascamenopause merupakan kondisi yang umum terjadi pada wanita setelah menopause, ditandai dengan penurunan kepadatan tulang dan peningkatan risiko fraktur. Untuk memahami mekanisme genetik yang mendasari kondisi ini, analisis ekspresi gen dilakukan pada sampel wanita dengan osteoporosis pascamenopause dan dibandingkan dengan kelompok kontrol berkepadatan tulang normal. Dalam penelitian ini dilakukan pathway Enrichment analysis untuk mengidentifikasi jalur biologis yang terlibat, serta digunakan STRING App pada perangkat lunak Cytoscape guna memvisualisasikan dan menganalisis interaksi antar gen (gene-gene interaction). Pada analisis ekspresi gen wanita dengan osteoporosis pascamenopause, ditemukan 178 gen yang terekspresi secara berbeda secara signifikan. Sebagian besar gen sebanyak 167 mengalami peningkatan ekspresi osteoporosis dan membentuk 43 interaksi dalam jaringan gen. Sementara itu, hanya 11 gen yang mengalami penurunan ekspresi pada kondisi osteoporosis. Berdasarkan hasil analisis, dapat disimpulkan bahwa RPL5, RPL34, RPS8, RPS28, CNN1, dan ACTG2 merupakan key genes yang berperan penting dalam mekanisme perkembangan osteoporosis pada wanita pascamenopause dengan pathways cytoplasmic ribosomal proteins WP477 merupakan jalur biologis yang teridentifikasi signifikan secara statistik.