PENERAPAN METODE SUPPORT VECTOR MACHINE (SVM) DALAM MENGKLASIFIKASI DATA BIOINFORMATIKA (Studi Kasus: Mengklasifikasi pasien yang terkena dan tidak terkena HIV, GSE28160)

Abstract

Human Immunodeficiency Virus atau HIV adalah virus yang menyerang sel darah putih di dalam tubuh yang mengakibatkan turunnya kekebalan tubuh manusia. Orang yang dalam darahnya terdapat virus HIV dapat tampak sehat dan belum tentu membutuhkan pengobatan. Epidemiologi demensia (penurunan kemampuan fungsi otak) terkait infeksi yang ter-dokumentasikan dengan baik saat ini adalah demensia terkait HIV-1 (HIV-1 associated dementia/HAD). Prevalensi HAD di Asia Pasifik sebesar 12%, di Afrika Selatan dan Uganda masing-masing sebesar 25,4% dan 31%, dan di negara maju sebesar 10%. Terkait permasalahan HIV-1 data diambil dari website NCBI, GSE28160, yang terdiri dari 35 pasien dengan 9 orang tidak terjangkit dan 26 orang terjangkit HIV-1 dengan banyaknya gen 54675. Sebelum analisis dilakukan pre-processing, filtering, dan feature selection. Support Vector Machine (SVM) menggunakan kernel linear memberikan akurasi sebesar 85,7%.