APLIKASI BAHASA PEMROGRAMAN R UNTUK ANALISIS QUANTITATIVE TRAIT LOCI (QTL) TERKAIT UKURAN BUAH PADA TANAMAN TOMAT (Solanum lycopersicum)

Abstract

Pada umumnya, kualitas buah tomat yang diharapkan masyarakat adalah buah tomat yang warna kulitnya merah, bentuk buah agak lonjong, ukuran buah agak besar, rasa buah manis, dan buahnya yang renyah. Kendala yang dihadapi petani dalam memenuhi kebutuhan pasar adalah ketidaksesuaian antara kualitas yang diharapkan masyarakat dengan kualitas produk yang dihasilkan. Salah satu ketidaksesuaiannya adalah ukuran buah tomat. Sifat dan ciri ukuran buah tomat yang akan diamati adalah diameter, panjang, dan berat buah tomat. Pada penelitian ini bertujuan untuk mengetahui marka yang berpengaruh signifikan terhadap ukuran buah tomat dengan menggunakan analisis Quantitative Trait Loci (QTL). Data yang digunakan adalah data marka SNPs hasil persilangan antara buah tomat besar dengan lokul banyak dan buah tomat kecil dengan lokul sedikit. Hasil analisis QTL dengan menggunakan software R didapat 2 marka yang signifikan yaitu Fw 2.2-209 dan Fas-101. Diperoleh hasil untuk panjang buah tomat berkontribusi sebesar 26.574%, pada berat buah tomat memberikan kontribusi sebesar 59.4%, dan diameter buah tomat berkontribusi sebesar 28.695% terhadap diameter buah tomat.