Identifikasi Gen Penyebab Dengue pada Anak-anak menggunakan Hidden Markov Model (Studi Kasus : Klasifikasi Gen Pada 3 Tipe Virus Dengue, GSE140809)

Abstract

Dengue merupakan salah satu penyakit menular pada manusia yang disebarkan melalui gigitan nyamuk yang terinfeksi. Transmisi yang berlangsung sejak awal 2023, digabungkan dengan lonjakan yang tak terduga pada kasus dengue, menyebabkan tercatatnya sejarah atas lebih dari 6,5 juta kasus dan lebih dari 7.300 kematian yang disebabkan oleh dengue. Dari 500.000 kasus dengue di negara tropis yang memerlukan perawatan di rumah sakit setiap tahunnya, persentase kematian yang tercatat berada dalam rentang 2,5 dan 5%, namun angka tersebut dapat mencapai 20% pada anak-anak jika tidak segera diberikan pengobatan yang tepat. Klasifikasi menggunakan metode Hidden Markov Models (HMM) pada data GSE140809 untuk menentukan tipe virus demam berdarah yang diderita pasien berdasarkan ekspresi gen. Berdasarkan hasil analisis HMM mampu memprediksi kelas dengan nilai AUC multi-class pada 1 simulasi menunjukkan kategori baik sebesar 0.847, dengan nilai AUC pada masing-masing kelas DV1 sebesar 0.833, DV2 sebesar 0.858, dan DV3 sebesar 0.85.