Identifikasi DNA Babi pada Cangkang Kapsul Menggunakan Real-time Polymerase Chain Reaction Spesifik 12s rRNA

Abstract

Latar Belakang: Cangkang kapsul umumnya terbuat dari gelatin. Penggunaan gelatin babi menimbulkan isu kehalalan bagi umat islam. Identifikasi sumber gelatin dilakukan menggunakan Real-Time PCR target gen 12s rRNA. DNA diekstraksi sesuai karakteristik cangkang kapsul menggunakan dua metode: kolom dan pelarut, untuk memperoleh konsentrasi dan kemurnian DNA yang optimal. Tujuan: Untuk menentukan metode ekstraksi DNA yang terbaik sesuai karakteristik cangkang kapsul. Untuk mengidentifikasi merek cangkang kapsul yang mengandung DNA babi dari hasil pada Real-Time PCR dengan gen 12s rRNA. Metode: Sampel dikumpulkan melaluistratified random sampling berdasarkan izin edar dan logo halal. DNA diekstraksi dengan metode spin column dan fenol- kloroform-isoamil alkohol (PCI) rasio 25:24:1 v/v. Kemurnian dan konsentrasi diuji dengan spektroforometer UV-Vis (rasio OD260/280; OD260/230). Deteksi DNA babi menggunakan Real-Time PCR target gen 12s rRNA dengan SYBR-Green, dianalisis berdasarkan nilai Cq dan Tm. Hasil: Metode pelarut memberikan konsentrasi DNA tertinggi (111,38 ng; sampel G), dan secara umum lebih tinggi dari metode kit kolom. Tujuh merek kapsul tidak terdeteksi mengandung DNA babi. Kontrol positif (274,48 ng), menunjukkan nilai Cq rendah (5,17 dan 3,96), dan Tm 78,50°C menandakan keberhasilan amplifikasi DNA babi. Batas deteksi terendah 0,002 ng menunjukkan DNA babi dalam sampel dibawah ambang deteksi.